More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1453 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  289  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  50.68 
 
 		 504 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  52.14 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  49.66 
 
 		 505 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  54.41 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  46.9 
 
 		 503 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  54.41 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  52.21 
 
 		 161 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  45.7 
 
 		 513 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  45.7 
 
 		 513 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  47.26 
 
 		 502 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  54.29 
 
 		 472 aa  107  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  47.41 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  44.81 
 
 		 540 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  47.15 
 
 		 506 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  50.89 
 
 		 549 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  46.88 
 
 		 506 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  50.89 
 
 		 542 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  46.58 
 
 		 509 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  54.95 
 
 		 176 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  45.58 
 
 		 523 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  46.88 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  47.15 
 
 		 505 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  49.56 
 
 		 497 aa  97.1  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  47.15 
 
 		 505 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  45.83 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  44 
 
 		 562 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  35.71 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  33.77 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  47.06 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  35.06 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  46.67 
 
 		 529 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  46 
 
 		 514 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  47.41 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.01 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  52.71 
 
 		 498 aa  91.3  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  45.45 
 
 		 507 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  45.45 
 
 		 507 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  36.22 
 
 		 176 aa  89.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  34.42 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.97 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  38.84 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  37.24 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  36.55 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  37.16 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  36.55 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  36.69 
 
 		 188 aa  87.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  33.99 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  37.16 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  47.79 
 
 		 529 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  36.55 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  36.23 
 
 		 176 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  37.69 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  33.56 
 
 		 160 aa  84.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  36.81 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  42.5 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  37.6 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  41.23 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  37.41 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  32.87 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  39.37 
 
 		 167 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.83 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  34.92 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  37.6 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  43.36 
 
 		 509 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  37.6 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  32.54 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  35.57 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  34.64 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  35.77 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  31.2 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  35.38 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  37.6 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  35.14 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37266  predicted protein  51.11 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  46 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  34.96 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  34.96 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  34.96 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  34.87 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  34.96 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  33.99 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  33.99 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  34.51 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  34 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  34 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  43 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  34 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  34.35 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  35.94 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  46.34 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  35.94 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  32 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  34.11 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  32.46 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  33.33 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  37.14 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>