More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0060 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0060  SsrA-binding protein  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0695  SsrA-binding protein  82.67 
 
 		 150 aa  258  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  77.48 
 
 		 151 aa  245  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1111  SsrA-binding protein  72.48 
 
 		 153 aa  230  5e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0617  SsrA-binding protein  71.81 
 
 		 150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.412585  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1123  SsrA-binding protein  71.81 
 
 		 150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1248  SsrA-binding protein  71.14 
 
 		 150 aa  210  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1060  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 152 aa  204  3e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  60 
 
 		 154 aa  182  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  54.67 
 
 		 150 aa  170  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  54.68 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1393  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00517715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43050  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.490843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 155 aa  133  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  48.05 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  48 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  44.93 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  43.54 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2005  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5488  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63060  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1520  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  43.71 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1463  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0677616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1590  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  43.05 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  42.76 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  44.83 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  43.92 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  42.76 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01177  SsrA-binding protein  44.67 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2049  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189824  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0959  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 160 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2412  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1532  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  43.84 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2558  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1303  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840826  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2032  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.17643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2467  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.838466  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6078  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1999  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3632  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.865786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2019  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3280  SsrA-binding protein  47.41 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.234096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>