More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0801 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4120  vitamin K epoxide reductase  43.57 
 
 
847 aa  760    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0801  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
849 aa  1738    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1471  hypothetical protein  47.21 
 
 
830 aa  776    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1988  DNA polymerase 3, epsilon subunit  42.31 
 
 
870 aa  701    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2555  vitamin K epoxide reductase  57.75 
 
 
862 aa  1000    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01480  DNA polymerase 3, epsilon subunit  42.86 
 
 
824 aa  701    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2738  Vitamin K epoxide reductase  39.48 
 
 
490 aa  334  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2743  Vitamin K epoxide reductase  47.46 
 
 
178 aa  168  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2752  vitamin K epoxide reductase  36.87 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.69 
 
 
336 aa  88.6  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
321 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.28 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
336 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4912  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.66 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 
319 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.99 
 
 
501 aa  75.5  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
322 aa  73.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
310 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.46 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00880027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  22.83 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  21.8 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
680 aa  71.2  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.84 
 
 
330 aa  70.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.97 
 
 
340 aa  70.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 
315 aa  70.5  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  23.05 
 
 
326 aa  70.1  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.64 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  21.61 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.91 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  21.73 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.35 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.99 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
310 aa  67  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  25.07 
 
 
327 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.57 
 
 
339 aa  66.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
299 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  28.07 
 
 
337 aa  65.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  23.45 
 
 
318 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.41 
 
 
320 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
321 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
338 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.83 
 
 
328 aa  65.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.3 
 
 
342 aa  65.1  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0540  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.24 
 
 
363 aa  64.7  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
346 aa  65.1  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.19 
 
 
319 aa  64.7  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.47 
 
 
342 aa  65.1  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  23.14 
 
 
332 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.19 
 
 
320 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.8 
 
 
466 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0707  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.78 
 
 
339 aa  63.9  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0585358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.8 
 
 
466 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
317 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.41 
 
 
344 aa  63.5  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3431  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.91 
 
 
337 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
348 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.8 
 
 
466 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 
318 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  24.57 
 
 
329 aa  63.9  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.09 
 
 
304 aa  63.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.17 
 
 
313 aa  63.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.99 
 
 
320 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.12 
 
 
330 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  26.22 
 
 
290 aa  63.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2992  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.73 
 
 
356 aa  63.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.147327  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  24.35 
 
 
302 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  29.75 
 
 
353 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  26.15 
 
 
328 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.58 
 
 
508 aa  63.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  26.39 
 
 
289 aa  62.4  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
311 aa  62.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
309 aa  62.4  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  22.42 
 
 
320 aa  62.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  22.05 
 
 
345 aa  62.8  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.25 
 
 
350 aa  62.4  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
349 aa  62  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  23.75 
 
 
336 aa  62  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3844  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.9 
 
 
346 aa  61.6  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22 
 
 
322 aa  62  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  29.69 
 
 
334 aa  61.6  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  22.29 
 
 
323 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  21.85 
 
 
326 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  21.7 
 
 
349 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  31.79 
 
 
334 aa  61.6  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
347 aa  61.6  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  21.7 
 
 
349 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
345 aa  61.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.41 
 
 
324 aa  61.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  22.08 
 
 
344 aa  61.2  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.39 
 
 
321 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.76 
 
 
353 aa  61.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.17 
 
 
340 aa  61.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
317 aa  61.2  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>