13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2752 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2752  vitamin K epoxide reductase  100 
 
 		 177 aa  345  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2743  Vitamin K epoxide reductase  47.46 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2738  Vitamin K epoxide reductase  42.77 
 
 		 490 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1471  hypothetical protein  40.8 
 
 		 830 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1988  DNA polymerase 3, epsilon subunit  38.42 
 
 		 870 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01480  DNA polymerase 3, epsilon subunit  36.46 
 
 		 824 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4120  vitamin K epoxide reductase  41.21 
 
 		 847 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2555  vitamin K epoxide reductase  36.81 
 
 		 862 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0801  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.87 
 
 		 849 aa  115  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2336  thioredoxin domain-containing protein  31.25 
 
 		 309 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.560711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02171  hypothetical protein  28.57 
 
 		 313 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2005  Vitamin K epoxide reductase  31.4 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00854012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0633  vitamin K epoxide reductase  26.97 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>