12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2738 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2738  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 		 490 aa  978    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2555  vitamin K epoxide reductase  41.3 
 
 		 862 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1471  hypothetical protein  42.24 
 
 		 830 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01480  DNA polymerase 3, epsilon subunit  38.1 
 
 		 824 aa  332  7.000000000000001e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0801  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  39.48 
 
 		 849 aa  328  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1988  DNA polymerase 3, epsilon subunit  33.84 
 
 		 870 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4120  vitamin K epoxide reductase  37.32 
 
 		 847 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2743  Vitamin K epoxide reductase  49.71 
 
 		 178 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2752  vitamin K epoxide reductase  43.02 
 
 		 177 aa  123  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0450  hypothetical protein  24.93 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.184881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2753  hypothetical protein  46.97 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2742  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.84 
 
 		 112 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>