9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2742 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2742  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 112 aa  223  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2753  hypothetical protein  43.66 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2555  vitamin K epoxide reductase  35.64 
 
 		 862 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0801  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.95 
 
 		 849 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1471  hypothetical protein  34.65 
 
 		 830 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4120  vitamin K epoxide reductase  32.04 
 
 		 847 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1988  DNA polymerase 3, epsilon subunit  32.67 
 
 		 870 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01480  DNA polymerase 3, epsilon subunit  33.68 
 
 		 824 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2738  Vitamin K epoxide reductase  50 
 
 		 490 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>