More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05725 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
96 aa  192  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  58.33 
 
 
96 aa  123  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1149  Ribosomal protein L25/L23  64.58 
 
 
95 aa  118  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000523481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  51.04 
 
 
96 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 
95 aa  100  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  45.36 
 
 
97 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 
99 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 
95 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  44.21 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 
95 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  42.11 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  43.62 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  42.71 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 
93 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  42.71 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
96 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  41.94 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  41.24 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  39.56 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  41.49 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  39.18 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  44.09 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  45.36 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  39.78 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  41.05 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  40 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  36.96 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  41.57 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  36.46 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  40.22 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  40.86 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  38.71 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0479  Ribosomal protein L25/L23  40.86 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0302  Ribosomal protein L25/L23  41.05 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.055916  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  43.33 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  34.38 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  39.13 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  35.79 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1228  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.195733  unclonable  0.00000945894 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  38.64 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  37.23 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  37.23 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  34.78 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  42.22 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>