More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0289 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
97 aa  187  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  58.33 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  54.12 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 
94 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  49.46 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  52.87 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  53.01 
 
 
95 aa  77  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1228  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.195733  unclonable  0.00000945894 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  53.01 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  48.28 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  52.22 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  51.9 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  43.16 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  39.78 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  49.38 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  55 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  45.05 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0479  Ribosomal protein L25/L23  43.68 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  49.38 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000118285  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  38.89 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  41.41 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  46.51 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  44.9 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 
99 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  54.32 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  41.86 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  decreased coverage  0.0000412321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0205  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  47.13 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  44.9 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  41.86 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  48.89 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  41.11 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3336  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000112822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  51.81 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  44.71 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>