More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1136 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  100 
 
 
100 aa  199  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  72.45 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  60 
 
 
100 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  60 
 
 
100 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  55 
 
 
98 aa  101  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  58.51 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  49.48 
 
 
98 aa  90.1  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  55.81 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  52.04 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  53.76 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  53.49 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
95 aa  84.3  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  58.33 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  57.95 
 
 
97 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 
94 aa  83.6  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  53.26 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  50.53 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  56.47 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  54.02 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
97 aa  76.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  51.16 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  48.24 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  55.56 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  49.41 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  53.49 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  50.56 
 
 
96 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  52.33 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  42.39 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  41.76 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>