More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05555 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  52.79 
 
 		 709 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  65 
 
 		 675 aa  860    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  52.1 
 
 		 671 aa  711    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  100 
 
 		 674 aa  1375    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.85 
 
 		 714 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.25 
 
 		 726 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.05 
 
 		 742 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.6 
 
 		 742 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.61 
 
 		 727 aa  600  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.34 
 
 		 726 aa  602  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.31 
 
 		 734 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.45 
 
 		 742 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.01 
 
 		 734 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.16 
 
 		 734 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.8 
 
 		 726 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.01 
 
 		 734 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.16 
 
 		 729 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.46 
 
 		 725 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.17 
 
 		 848 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.69 
 
 		 730 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.42 
 
 		 736 aa  538  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1789  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.18 
 
 		 678 aa  508  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.31 
 
 		 682 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  38.35 
 
 		 694 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.09 
 
 		 689 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  38.17 
 
 		 680 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.62 
 
 		 683 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.53 
 
 		 689 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  36.44 
 
 		 682 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.59 
 
 		 687 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  38.09 
 
 		 680 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.16 
 
 		 682 aa  479  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  37.43 
 
 		 695 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.01 
 
 		 733 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.91 
 
 		 696 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.02 
 
 		 696 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  36.63 
 
 		 686 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  36.98 
 
 		 682 aa  475  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  37.22 
 
 		 675 aa  473  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.67 
 
 		 681 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.31 
 
 		 696 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  36.24 
 
 		 681 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  37.72 
 
 		 693 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.22 
 
 		 716 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.72 
 
 		 694 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  36.15 
 
 		 681 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  36.69 
 
 		 680 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  37.94 
 
 		 683 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  38.38 
 
 		 722 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.65 
 
 		 711 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  36.69 
 
 		 680 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  36.19 
 
 		 679 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  35.5 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.64 
 
 		 717 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  35.4 
 
 		 685 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  36.24 
 
 		 680 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  36.59 
 
 		 676 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  36.58 
 
 		 679 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  36.81 
 
 		 682 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.78 
 
 		 716 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  35.65 
 
 		 680 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  35.36 
 
 		 681 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  34.76 
 
 		 683 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  36.82 
 
 		 680 aa  458  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  36.09 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  34.91 
 
 		 695 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  36.09 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.2 
 
 		 671 aa  458  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.91 
 
 		 716 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.63 
 
 		 716 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  37.72 
 
 		 679 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  36.09 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  34.91 
 
 		 695 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  35.95 
 
 		 680 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  34.32 
 
 		 682 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.79 
 
 		 695 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.94 
 
 		 695 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.21 
 
 		 723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  34.76 
 
 		 695 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.35 
 
 		 723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  35.49 
 
 		 683 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.49 
 
 		 714 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0912  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.62 
 
 		 674 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.72 
 
 		 712 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  36.71 
 
 		 685 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  36.09 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  36.09 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.71 
 
 		 699 aa  452  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  35.36 
 
 		 683 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  36.09 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  35.36 
 
 		 683 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  35.85 
 
 		 679 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.19 
 
 		 716 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.69 
 
 		 696 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  34.91 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  35.04 
 
 		 716 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  36.09 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  34.91 
 
 		 681 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.04 
 
 		 716 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.95 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>