More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0700 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  39.34 
 
 
282 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
282 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
282 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
281 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1749  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.48 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4357  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.25 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.661723  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.48 
 
 
310 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.48 
 
 
310 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1987  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 
299 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2700  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
322 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00977589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
285 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  32.49 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
275 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2696  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.33 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
278 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
308 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
298 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
298 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  31.14 
 
 
292 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
318 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
312 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
298 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
302 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
263 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
260 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5223  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  38 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136536  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5636  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  38 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603741  decreased coverage  0.00134982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0050  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  37 
 
 
276 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311743  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.67 
 
 
659 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  28.43 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5465  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  37.5 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4916  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  37.5 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4593  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  37.5 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
272 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  32.99 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1104  naphthoate synthase  33.62 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1127  naphthoate synthase  33.62 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0434523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.67 
 
 
255 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1270  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00698519  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  37.66 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  33.76 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40076  predicted protein  36.16 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  31.83 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1004  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  36.97 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  34.91 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  35.78 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  35.78 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  35.27 
 
 
272 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.3 
 
 
269 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
270 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0976  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
312 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0994  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
312 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
248 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4870  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  34 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00246591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  34.08 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0632  naphthoate synthase  32.33 
 
 
272 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.556463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
254 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  32.6 
 
 
258 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
258 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.95 
 
 
259 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3210  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.84 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324324  normal  0.0213187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  32.03 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  36.65 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  37.95 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.28 
 
 
663 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6107  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  34.68 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1463  short chain enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.225465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  31.36 
 
 
302 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.92 
 
 
259 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 
258 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.07 
 
 
296 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.78 
 
 
662 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3116  naphthoate synthase  35.02 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0805389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  34.76 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.75 
 
 
262 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
259 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>