More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3856 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  88.89 
 
 
406 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  100 
 
 
404 aa  825    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  65.35 
 
 
394 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  60.27 
 
 
385 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  42.12 
 
 
397 aa  322  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  47.11 
 
 
395 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  42.01 
 
 
400 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  33.93 
 
 
415 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
395 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
388 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.15 
 
 
393 aa  146  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.1 
 
 
398 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.1 
 
 
398 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.34 
 
 
383 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  28.5 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
389 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
396 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
394 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
378 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
384 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
400 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  26.15 
 
 
359 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  32.61 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
411 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
376 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.48 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.12 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.38 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.11 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  24.31 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.83 
 
 
536 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
353 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
819 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  37.38 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  39.45 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  26.05 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
772 aa  68.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
370 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.85 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
413 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  27.27 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
810 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  28.76 
 
 
383 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  27.22 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  27.45 
 
 
458 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.26 
 
 
375 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>