More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3715 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  80.84 
 
 		 382 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1574  glycosyl transferase family 9  33.33 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  31.65 
 
 		 386 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  26.56 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  26.83 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  27.81 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  28.29 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.83 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.83 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  27.14 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.98 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.48 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.48 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.48 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.48 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  24.34 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.48 
 
 		 394 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  30.67 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.31 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  22.49 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.13 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  28.49 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  29.13 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 475 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.08 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  35.04 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.17 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  25.42 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  32.84 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.88 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  33.61 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  33.61 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  32.76 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  31.47 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  33.61 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  24.74 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.55 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  33.61 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  33.61 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  33.61 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.94 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.67 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  34.21 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.04 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  32.79 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  21.84 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.14 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.14 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.92 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.55 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.53 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  28.93 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  33.9 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.25 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.12 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4048  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.93 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000904915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.42 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  30.51 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0167  glycosyl transferase family 9  34.4 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  25.32 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.64 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.42 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.52 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.82 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  25.27 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.85 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  25.52 
 
 		 781 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  23.55 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  23.48 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  26.97 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>