138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3201 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 494 aa  1008    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  42.13 
 
 		 458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  40.82 
 
 		 484 aa  296  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  43.52 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  37.08 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  34.05 
 
 		 471 aa  216  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  35.93 
 
 		 443 aa  216  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  35.76 
 
 		 499 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  35.1 
 
 		 442 aa  213  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  33.83 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  33.64 
 
 		 422 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  33.41 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  33.47 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  32.82 
 
 		 445 aa  187  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  27.86 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  27.64 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  29.88 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  27.66 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  27.08 
 
 		 377 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  26.01 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  26.36 
 
 		 386 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  26.88 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  26.44 
 
 		 386 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01880  hypothetical protein  64.91 
 
 		 59 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0620903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  26.93 
 
 		 587 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  27.69 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  32 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  26.79 
 
 		 667 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 633 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  26.15 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  29.68 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  31.98 
 
 		 631 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  27.54 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  23.72 
 
 		 593 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  29.85 
 
 		 629 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  31.91 
 
 		 786 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.72 
 
 		 593 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  25.19 
 
 		 593 aa  54.7  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  24.7 
 
 		 689 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  29.63 
 
 		 634 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  24.44 
 
 		 738 aa  53.9  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  27.71 
 
 		 638 aa  53.9  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  29.32 
 
 		 693 aa  53.5  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  28.21 
 
 		 638 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  27.65 
 
 		 697 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 		 627 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  22.07 
 
 		 716 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  24.33 
 
 		 625 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  27.39 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  32.28 
 
 		 640 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  29.14 
 
 		 821 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  23.16 
 
 		 651 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  28.39 
 
 		 699 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  28.39 
 
 		 699 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  29.49 
 
 		 607 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  28.39 
 
 		 699 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  29.94 
 
 		 651 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  33.59 
 
 		 669 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  25.95 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  26.52 
 
 		 624 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  28 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 726 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4464  hypothetical protein  25.95 
 
 		 735 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  29.31 
 
 		 625 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  26.48 
 
 		 642 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  28.57 
 
 		 647 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  24.12 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  30.25 
 
 		 674 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  27.34 
 
 		 663 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  25 
 
 		 663 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  29.07 
 
 		 694 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  30 
 
 		 663 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  27.1 
 
 		 654 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  27.1 
 
 		 654 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  23.62 
 
 		 628 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  25.85 
 
 		 685 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  26.18 
 
 		 690 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  25.11 
 
 		 718 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  24.71 
 
 		 612 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  31.4 
 
 		 650 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  27.1 
 
 		 678 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  24.44 
 
 		 672 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  27.1 
 
 		 678 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  25.85 
 
 		 685 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  24.44 
 
 		 672 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  25.85 
 
 		 685 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  27.22 
 
 		 653 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  27.82 
 
 		 652 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  24.32 
 
 		 651 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  31.06 
 
 		 630 aa  47  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  31.4 
 
 		 650 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  25.61 
 
 		 684 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  27.54 
 
 		 691 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  30.06 
 
 		 677 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  29.37 
 
 		 690 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  28.57 
 
 		 647 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  29.73 
 
 		 631 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  28 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>