More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5284 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5284  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
717 aa  1457    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6741  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.5 
 
 
728 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1330  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  90.52 
 
 
717 aa  1332    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4144  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
760 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.02765  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7023  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 
763 aa  588  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180026  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.79 
 
 
759 aa  581  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0137592  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  44.02 
 
 
760 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1137  sensor histidine kinase/response regulator  44.02 
 
 
760 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  44.02 
 
 
760 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  44.02 
 
 
767 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5512  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 
746 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294754  normal  0.0542916 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1417  sensor histidine kinase/response regulator  44.02 
 
 
767 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000575152  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  43.88 
 
 
760 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0010  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 
764 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00266104  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2366  sensor histidine kinase/response regulator  44.6 
 
 
768 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00256663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3167  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 
758 aa  568  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000450225  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4959  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.71 
 
 
746 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00168647  normal  0.0243136 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  44.32 
 
 
725 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4548  histidine kinase  43.66 
 
 
749 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000713404  normal  0.70634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5171  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.66 
 
 
749 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00341574  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5688  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.66 
 
 
749 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00115642  decreased coverage  0.000406473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
712 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
722 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
716 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
707 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
705 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
702 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6011  histidine kinase  32.41 
 
 
743 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0568406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
704 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
754 aa  293  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
701 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  31.95 
 
 
701 aa  278  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
762 aa  275  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
740 aa  247  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 
662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  38.66 
 
 
726 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
741 aa  243  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 
641 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  39.28 
 
 
541 aa  236  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  39.28 
 
 
541 aa  236  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
622 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
559 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
889 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
575 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
1022 aa  234  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
998 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
522 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  37.26 
 
 
541 aa  232  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
812 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  37.27 
 
 
564 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  38.27 
 
 
1225 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1225 aa  229  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
1215 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  38.06 
 
 
575 aa  228  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
845 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  37.3 
 
 
573 aa  228  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
864 aa  226  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
630 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
548 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
772 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
814 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
949 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  37.37 
 
 
949 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
732 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
743 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
689 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 
721 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
789 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  35.71 
 
 
691 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
573 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
1381 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1631 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
1095 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
789 aa  224  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
789 aa  224  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
1089 aa  224  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1651 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  36.7 
 
 
695 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
890 aa  223  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
795 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  36.88 
 
 
676 aa  223  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  34.4 
 
 
537 aa  223  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  34.4 
 
 
692 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
827 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
922 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
691 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  35.97 
 
 
691 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
999 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  36.22 
 
 
847 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
957 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
640 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  37.06 
 
 
676 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
1164 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
943 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
686 aa  221  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 
588 aa  221  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131409  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  36.17 
 
 
1065 aa  221  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
943 aa  220  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
728 aa  220  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>