73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0394 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  89.64 
 
 		 338 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  100 
 
 		 338 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  70.39 
 
 		 332 aa  495  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  36.81 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  41.09 
 
 		 819 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  29.55 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  27.2 
 
 		 294 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  32.2 
 
 		 402 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  29.73 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  26.97 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  28.89 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  28.89 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  28.89 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  27.95 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  31.87 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  26 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.13 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  26.78 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  27.63 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  28.06 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  28.06 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  28.06 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  28.06 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  28.06 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  28.06 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  28.06 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  29.32 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.2 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.7 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  26.03 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  25.21 
 
 		 508 aa  72.8  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.69 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  36.61 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  36.61 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  36.45 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  32.71 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  29.53 
 
 		 568 aa  65.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  25.09 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  24.72 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  25.77 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  34.65 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  37.14 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  26.59 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  24.89 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  36.54 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  29.23 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.73 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.03 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.98 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.25 
 
 		 281 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48391  predicted protein  26.9 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.68 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  31.82 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  29.13 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.79 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.19 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  25.69 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  30.09 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  24.35 
 
 		 1068 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  22.53 
 
 		 535 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  32.2 
 
 		 586 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01870  conserved hypothetical protein  23.47 
 
 		 529 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.37 
 
 		 334 aa  46.2  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  28.82 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  25.85 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  22.57 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.17 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  30.09 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  29.36 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  32.41 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>