More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6598 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
283 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  73.76 
 
 
283 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  74.38 
 
 
286 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  69.75 
 
 
283 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  69.15 
 
 
284 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  70.11 
 
 
283 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  70.11 
 
 
283 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  70.11 
 
 
283 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  69.4 
 
 
283 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  69.4 
 
 
283 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  63.86 
 
 
293 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  58.43 
 
 
307 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  58.11 
 
 
285 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  57.36 
 
 
260 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  42.8 
 
 
283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  42.42 
 
 
287 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
287 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
394 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
267 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  29.23 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  25.09 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.94 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  36.49 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  26.34 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  34.58 
 
 
262 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0368  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
355 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.324688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.38 
 
 
372 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  24.63 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.9 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  29.2 
 
 
219 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  21.45 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
275 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.05 
 
 
293 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.81 
 
 
370 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
301 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
351 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.38 
 
 
290 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.92 
 
 
273 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
264 aa  62.4  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.61 
 
 
380 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  24.05 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  31.65 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  28.79 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.43 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  32.73 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  32.73 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.96 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
361 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  30.95 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 
328 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  31.2 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  20.9 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.96 
 
 
372 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  24.46 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  20.9 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.33 
 
 
263 aa  59.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  20.9 
 
 
270 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
256 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  32.73 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  33.06 
 
 
247 aa  59.3  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 
333 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
258 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  23.84 
 
 
287 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>