116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6423 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  65.46 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  64.29 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  65.28 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  65.28 
 
 		 210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  65.28 
 
 		 210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  64.77 
 
 		 210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  65.15 
 
 		 210 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  64.92 
 
 		 361 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  64.92 
 
 		 378 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  64.92 
 
 		 378 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  63.54 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  64.92 
 
 		 366 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  64.92 
 
 		 366 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  64.58 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  64.4 
 
 		 374 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  64.4 
 
 		 373 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  67.18 
 
 		 223 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  64.4 
 
 		 336 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  58.29 
 
 		 201 aa  229  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  59.69 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  61.66 
 
 		 212 aa  227  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  58.79 
 
 		 198 aa  226  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  61.93 
 
 		 217 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  56.7 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  59.9 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  58.08 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  58.38 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  58.59 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  58.79 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  58.08 
 
 		 224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  58.33 
 
 		 214 aa  197  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  54.64 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  55.05 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  52.82 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  54.64 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  56.99 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  53.23 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  54.17 
 
 		 212 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  55.73 
 
 		 210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  55.21 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  48.13 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  47.12 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  49.2 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  46.73 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  51.83 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  52.35 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  44.72 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  51.25 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  50.62 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  39.42 
 
 		 216 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  40.19 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  42.76 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  33.73 
 
 		 288 aa  98.6  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  37.33 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  30.68 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  35.65 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  32.77 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  32 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  34.52 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  30.7 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  33.05 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  32 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  34.39 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  38.14 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  34.65 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  33.1 
 
 		 269 aa  62  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  33.1 
 
 		 266 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  25.32 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.51 
 
 		 517 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  30.17 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  35.71 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0863  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  27.89 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.627078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2321  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.63 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3146  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.09 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  36.97 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  36.97 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  26.91 
 
 		 495 aa  52  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.14 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.65 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  23.96 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  24.88 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1448  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  27.6 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0615119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0938  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  27.75 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.41 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.41 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.41 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.41 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.37 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  26.42 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0857  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.03 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  23.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  35.06 
 
 		 287 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.56 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  25 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  24.48 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.73 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0573  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.73 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15666  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  35.83 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>