164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5648 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  87.08 
 
 		 238 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  60.95 
 
 		 237 aa  254  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  60.48 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  60.48 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  60 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  60 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  59.52 
 
 		 235 aa  248  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  46.32 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  41.54 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  40.82 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  42.49 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  40.84 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  41.97 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  39.02 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  38.78 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  41.03 
 
 		 236 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  40.84 
 
 		 234 aa  147  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  42.05 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  38.14 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  36.95 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  36.59 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  34.09 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  36.79 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  39.18 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  31.61 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  30.93 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  36.84 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  28.89 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  30.73 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  32.99 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  31.68 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  32.26 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  29.69 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  26.13 
 
 		 461 aa  92.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  28.5 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  28.12 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  28.12 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  26.67 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  38.16 
 
 		 304 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  31.52 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  32.24 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  25.6 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  31.71 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  27.42 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  24.77 
 
 		 322 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  29.56 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  30.29 
 
 		 312 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  22.12 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  22.12 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  29.31 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  35.43 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  27.6 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  24.06 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  26.78 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  29.6 
 
 		 258 aa  74.7  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  25.93 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  25.93 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  30.29 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  24.24 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  32.03 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  28.08 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  32.23 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  29.01 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  28.24 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  25.41 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  30.58 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  26.15 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  25.13 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  28.05 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  28.46 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  28.1 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  27.78 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  31.62 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  31.62 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  30.77 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  32.35 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  24.87 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  23.53 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  24.62 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  24.62 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  26.42 
 
 		 313 aa  62  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  24.41 
 
 		 320 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>