More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4736 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  299  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  74.42 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  73.64 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  73.64 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  70.54 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  70.23 
 
 		 169 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  65.41 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  67.46 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  72.06 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  73.48 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  62.02 
 
 		 166 aa  174  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  70.29 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  73.85 
 
 		 139 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  60.31 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  57.25 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  73.02 
 
 		 174 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  71.43 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  71.43 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  71.43 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  71.43 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  58.27 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  71.43 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  59.69 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  71.43 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  59.06 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  58.27 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  55.47 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  49.62 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  47.97 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  46.21 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  40.71 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 		 241 aa  94  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  37.39 
 
 		 131 aa  93.6  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  33.94 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  38.52 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  31.3 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  31.3 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 233 aa  60.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  34.83 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.65 
 
 		 280 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 222 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  34.38 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  51.92 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  38.2 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  53.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  35.11 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 232 aa  52.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.88 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  29.89 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  35.48 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  32.14 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  32.91 
 
 		 352 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  36.67 
 
 		 553 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 550 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.25 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>