More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1433 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
302 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  82.59 
 
 
296 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  82.59 
 
 
296 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  80.89 
 
 
296 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  80.89 
 
 
300 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  80.89 
 
 
340 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  81.57 
 
 
296 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  80.89 
 
 
296 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  80.89 
 
 
296 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  82.59 
 
 
296 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  80.89 
 
 
296 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  82.59 
 
 
296 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  82.59 
 
 
296 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  80.89 
 
 
349 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  80.55 
 
 
296 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  82.59 
 
 
296 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  79.25 
 
 
294 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  78.91 
 
 
294 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  62.76 
 
 
305 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  62.76 
 
 
305 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  63.57 
 
 
297 aa  377  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  63.1 
 
 
307 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  61.38 
 
 
297 aa  338  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  50 
 
 
312 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  49.32 
 
 
299 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  49.04 
 
 
309 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  49.5 
 
 
311 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  49.67 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  47.02 
 
 
295 aa  265  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  50.33 
 
 
307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  47.95 
 
 
300 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  46.36 
 
 
313 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 
343 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 
289 aa  242  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 
339 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  44.12 
 
 
325 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 
309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
289 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
300 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
292 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  34.8 
 
 
285 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  35.55 
 
 
289 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  31 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
359 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.81 
 
 
2762 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  25.86 
 
 
282 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  25.86 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  28.82 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  27.69 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  26.78 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  38.6 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  42.96 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  28 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  33.12 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.73 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 
361 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.74 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  30.39 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  30.88 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 
590 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>