More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1136 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  81.76 
 
 		 148 aa  238  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  52.03 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  48.98 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  47.3 
 
 		 191 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  47.3 
 
 		 201 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  47.3 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  47.3 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  47.3 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  47.3 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  46.62 
 
 		 201 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  51.01 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  43.92 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  50.68 
 
 		 155 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  49.66 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  49.32 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  48.65 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  48.65 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  36.49 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  41.5 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  37.16 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  38.16 
 
 		 173 aa  87.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  36.84 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 162 aa  86.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  37.34 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  38.26 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  37.34 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  39.24 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  38.26 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  37.34 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  37.34 
 
 		 200 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  37.34 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  37.34 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  35.62 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  36.67 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  36.05 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  37.82 
 
 		 200 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  37.33 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  35.81 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  36.77 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  38.06 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  41.22 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  37.41 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  38.26 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  38.26 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  37.42 
 
 		 187 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  36.05 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  35.29 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  35.76 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  34.18 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  36.54 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  41.56 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  35.76 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  39.07 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  40.26 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1184  hypothetical protein  54.67 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  37.75 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  35.53 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.56 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  38.36 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  36.05 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  37.42 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.24 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  36.91 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.42 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  32.88 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>