More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0257 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  79.32 
 
 		 503 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  86.86 
 
 		 444 aa  731    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  86.86 
 
 		 478 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  79.68 
 
 		 502 aa  715    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  80.95 
 
 		 504 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  86.86 
 
 		 469 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  83.83 
 
 		 500 aa  753    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  81.24 
 
 		 499 aa  722    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  83.83 
 
 		 500 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  83.63 
 
 		 500 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  81.64 
 
 		 500 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  80.24 
 
 		 497 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  81.64 
 
 		 500 aa  740    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  83.63 
 
 		 500 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  100 
 
 		 501 aa  978    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  68.76 
 
 		 438 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  68.76 
 
 		 438 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  64.41 
 
 		 431 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  63.57 
 
 		 463 aa  511  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  60.63 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  64.52 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  59.73 
 
 		 435 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  59.11 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  61.63 
 
 		 466 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  58.62 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  61.17 
 
 		 445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  66.83 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  60.77 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  57.97 
 
 		 482 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  63.16 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  59.53 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  61.86 
 
 		 442 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  61.4 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  63.07 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  63.07 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  59.75 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  63.31 
 
 		 443 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  60.85 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  51.75 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  55.85 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  52.4 
 
 		 500 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  58.57 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  61.17 
 
 		 445 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  62.92 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  54.67 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  52.4 
 
 		 500 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  58.37 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  53.17 
 
 		 500 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  53.18 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  51.02 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  52.53 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  52.51 
 
 		 498 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  52.72 
 
 		 498 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  48.2 
 
 		 494 aa  438  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  56.39 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  51.84 
 
 		 524 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  51.84 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  51.82 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  53.67 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  54.37 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  53.67 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  55.21 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  52.44 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  53.26 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  51.11 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  52.55 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  49.68 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  50.53 
 
 		 480 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  53.55 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  51.83 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  52.49 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0473  ammonium transporter  54.11 
 
 		 522 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  54.61 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  53.32 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  51.44 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  51.2 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  56.05 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  53.42 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  50.96 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  51.2 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  50.82 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  51.2 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  50.35 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  50.44 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0373  ammonium transporter  50 
 
 		 480 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  53.49 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  52.31 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  51.59 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  54.48 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0121  ammonium transporter  52.51 
 
 		 521 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0596893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2734  ammonium transporter  51.18 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  50.93 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  51.59 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  50.99 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  49.29 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  46.43 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  49.76 
 
 		 466 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  49.89 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  49.51 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  50.47 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>