More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0833 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
304 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  95.39 
 
 
328 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  95.39 
 
 
328 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  94.41 
 
 
304 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  94.39 
 
 
304 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  92.43 
 
 
305 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  92.11 
 
 
305 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  88.67 
 
 
331 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  87.25 
 
 
337 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  89.23 
 
 
320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  89.19 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  89.19 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  89.19 
 
 
329 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  89.19 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  87.46 
 
 
331 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  73.55 
 
 
328 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  72.26 
 
 
321 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2220  LysR family transcriptional regulator  73.7 
 
 
317 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  65.99 
 
 
316 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  64.19 
 
 
318 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  64.69 
 
 
314 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2675  transcriptional regulator, LysR family  62.9 
 
 
314 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  64.07 
 
 
311 aa  325  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4657  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.933923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  54.36 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1491  LysR family transcriptional regulator  56.19 
 
 
308 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  53.22 
 
 
310 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1922  LysR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
322 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3010  LysR family transcriptional regulator  51.77 
 
 
309 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2531  transcriptional regulator, LysR family  52.09 
 
 
312 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  46.42 
 
 
292 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
295 aa  242  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1388  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
298 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 
296 aa  231  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
293 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
305 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 
299 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 
299 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  36.95 
 
 
301 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
301 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
301 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  36.95 
 
 
301 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  36.95 
 
 
301 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  36.95 
 
 
301 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  36.95 
 
 
301 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 
296 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
302 aa  205  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 
298 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
303 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
305 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  42.72 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  43.86 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
323 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
295 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
301 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  45.26 
 
 
296 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 
298 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  41.53 
 
 
301 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1832  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
300 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
297 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
300 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
300 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
296 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
300 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
300 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
300 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
300 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
300 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  42.81 
 
 
300 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  42.47 
 
 
300 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
295 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  41.45 
 
 
319 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
302 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 
298 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  39.45 
 
 
292 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  39.45 
 
 
292 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  39.45 
 
 
292 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
301 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  44.55 
 
 
337 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
308 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 
294 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
308 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 
296 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
308 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 
308 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
298 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
300 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
297 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
294 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>