More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2955 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  648    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  80.5 
 
 		 318 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  76.64 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  80.52 
 
 		 318 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  80.19 
 
 		 318 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 316 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 316 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 316 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  62.14 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  57.74 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  58.82 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  55.81 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 342 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  58.39 
 
 		 314 aa  355  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 312 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  55 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  50.94 
 
 		 319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 330 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 319 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 321 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  48.46 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  51.1 
 
 		 320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  52.79 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  50.48 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  50.8 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  54.49 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  54.49 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 315 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 315 aa  252  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  43.69 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.72 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  41.72 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  46.13 
 
 		 437 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 363 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  45.7 
 
 		 375 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  39.86 
 
 		 334 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  39.63 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  43.95 
 
 		 372 aa  198  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  40.64 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  44.05 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  38.23 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  42.42 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  44.86 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  41.11 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  39.86 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.53 
 
 		 344 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>