More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26670 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26670  tRNA-guanine transglycosylase  100 
 
 
427 aa  882    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5580  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.18 
 
 
401 aa  595  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.57 
 
 
402 aa  591  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4948  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.32 
 
 
410 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5329  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.32 
 
 
410 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380877  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5036  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.32 
 
 
410 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0727  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.56 
 
 
434 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03090  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.44 
 
 
441 aa  581  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.576454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0599  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.43 
 
 
435 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0560  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.73 
 
 
424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0411  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.65 
 
 
417 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1354  Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  59.13 
 
 
437 aa  511  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1343  tRNA-guanine transglycosylase  59.42 
 
 
441 aa  511  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.161378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.35 
 
 
1382 aa  485  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.06 
 
 
394 aa  342  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.54 
 
 
405 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.75 
 
 
400 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.79 
 
 
380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.1 
 
 
375 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.1 
 
 
392 aa  319  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.79 
 
 
370 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.61 
 
 
380 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.62 
 
 
369 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.03 
 
 
372 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3728  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.32 
 
 
403 aa  315  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.39 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.6 
 
 
372 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.25 
 
 
373 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.6 
 
 
372 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.6 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.85 
 
 
379 aa  309  5e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.85 
 
 
379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.26 
 
 
369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.85 
 
 
379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.88 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.24 
 
 
379 aa  306  7e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.56 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.76 
 
 
373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.24 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.85 
 
 
368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.99 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.99 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.26 
 
 
368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.56 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.99 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
379 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
379 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
379 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
379 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
379 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
379 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
379 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.49 
 
 
372 aa  301  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.6 
 
 
370 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.08 
 
 
384 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
370 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.49 
 
 
395 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.76 
 
 
375 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.6 
 
 
384 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.85 
 
 
387 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.85 
 
 
371 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.24 
 
 
380 aa  297  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.58 
 
 
368 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.59 
 
 
380 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
380 aa  296  5e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.43 
 
 
376 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.33 
 
 
374 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.9 
 
 
394 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.56 
 
 
373 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.96 
 
 
365 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0129  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.9 
 
 
404 aa  293  5e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.62 
 
 
336 aa  292  7e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.83 
 
 
372 aa  292  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.67 
 
 
371 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.1 
 
 
373 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.31 
 
 
368 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.67 
 
 
381 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.53 
 
 
373 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.67 
 
 
383 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.35 
 
 
391 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.75 
 
 
369 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.32 
 
 
392 aa  288  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.64 
 
 
367 aa  286  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.31 
 
 
368 aa  286  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.19 
 
 
367 aa  285  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.24 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.92 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4524  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.55 
 
 
408 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.46 
 
 
383 aa  282  9e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.97 
 
 
387 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0735  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.62 
 
 
404 aa  281  2e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0662532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.56 
 
 
392 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.85 
 
 
388 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.26 
 
 
394 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.45 
 
 
376 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.39 
 
 
378 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.79 
 
 
374 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.2 
 
 
383 aa  280  4e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.41 
 
 
396 aa  280  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.42206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>