More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5329 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5036  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
410 aa  845    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5329  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
410 aa  845    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380877  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5580  queuine tRNA-ribosyltransferase  86.22 
 
 
401 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  86.53 
 
 
402 aa  724    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4948  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
410 aa  845    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0560  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.77 
 
 
424 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26670  tRNA-guanine transglycosylase  70.32 
 
 
427 aa  589  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03090  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.23 
 
 
441 aa  574  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.576454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0727  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.26 
 
 
434 aa  564  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0599  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.5 
 
 
435 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0411  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.32 
 
 
417 aa  558  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.47 
 
 
1382 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1354  Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  60.36 
 
 
437 aa  513  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1343  tRNA-guanine transglycosylase  59.85 
 
 
441 aa  507  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.161378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.19 
 
 
394 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.99 
 
 
375 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.11 
 
 
373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.4 
 
 
372 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.86 
 
 
392 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.59 
 
 
380 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3728  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.42 
 
 
403 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.96 
 
 
400 aa  333  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.36 
 
 
372 aa  333  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.78 
 
 
379 aa  332  8e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.77 
 
 
369 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.36 
 
 
382 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.05 
 
 
372 aa  328  8e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.78 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.24 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.44 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.1 
 
 
405 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.08 
 
 
374 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.4 
 
 
373 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.79 
 
 
380 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.43 
 
 
379 aa  323  3e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.65 
 
 
371 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.56 
 
 
380 aa  323  4e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.93 
 
 
369 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.33 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.33 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.89 
 
 
370 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.55 
 
 
383 aa  318  7e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.35 
 
 
368 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.28 
 
 
380 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.94 
 
 
368 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.49 
 
 
384 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.67 
 
 
373 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.61 
 
 
380 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.94 
 
 
368 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.79 
 
 
373 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.86 
 
 
370 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.69 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.11 
 
 
367 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.45 
 
 
383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.07 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.92 
 
 
379 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.94 
 
 
368 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.41 
 
 
379 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.42 
 
 
380 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.28 
 
 
387 aa  310  2e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.41 
 
 
379 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.15 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.15 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.15 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.15 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.15 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.15 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.15 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.07 
 
 
395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.85 
 
 
365 aa  309  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.18 
 
 
376 aa  308  9e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.74 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.07 
 
 
388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.85 
 
 
368 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.79 
 
 
383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.7 
 
 
373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.31 
 
 
381 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.01 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.98 
 
 
376 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.47 
 
 
376 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
381 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.73 
 
 
376 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.28 
 
 
388 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.97 
 
 
336 aa  300  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.86 
 
 
369 aa  300  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0577  queuine/other tRNA- ribosyl transferase  39.44 
 
 
396 aa  300  4e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0321694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.25 
 
 
374 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.11 
 
 
355 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.75 
 
 
394 aa  299  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.46 
 
 
373 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.44 
 
 
396 aa  298  1e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.42206  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0735  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
404 aa  297  2e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0662532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.36 
 
 
376 aa  298  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2335  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.46 
 
 
386 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.0584055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.94 
 
 
384 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.69 
 
 
380 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.69 
 
 
380 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.33 
 
 
375 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.21 
 
 
377 aa  295  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>