More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0599 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_03090  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.32 
 
 
441 aa  641    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.576454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0727  queuine tRNA-ribosyltransferase  88.28 
 
 
434 aa  806    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0599  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
435 aa  906    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0560  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.92 
 
 
424 aa  598  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5580  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.62 
 
 
401 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26670  tRNA-guanine transglycosylase  66.43 
 
 
427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.09 
 
 
402 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5036  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.5 
 
 
410 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5329  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.5 
 
 
410 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4948  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.5 
 
 
410 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0411  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.75 
 
 
417 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1343  tRNA-guanine transglycosylase  57.82 
 
 
441 aa  534  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.161378 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1354  Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  58.77 
 
 
437 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.8 
 
 
1382 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.44 
 
 
394 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.01 
 
 
373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.52 
 
 
380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.52 
 
 
379 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.52 
 
 
379 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.34 
 
 
370 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.26 
 
 
375 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3728  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.93 
 
 
403 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.4 
 
 
380 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.19 
 
 
373 aa  329  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.75 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.75 
 
 
372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.49 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.49 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.24 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
379 aa  326  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
379 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
379 aa  326  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
379 aa  326  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
379 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
379 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
379 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.41 
 
 
384 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.75 
 
 
368 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.62 
 
 
372 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.84 
 
 
372 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.49 
 
 
382 aa  322  6e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.36 
 
 
369 aa  322  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.97 
 
 
380 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.46 
 
 
405 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.05 
 
 
357 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.38 
 
 
379 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.78 
 
 
369 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.82 
 
 
365 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.56 
 
 
400 aa  317  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.36 
 
 
383 aa  316  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.41 
 
 
372 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.45 
 
 
368 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.71 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.19 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.93 
 
 
380 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.51 
 
 
380 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.67 
 
 
368 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.67 
 
 
368 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.34 
 
 
376 aa  310  5e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.68 
 
 
370 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.8 
 
 
371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.18 
 
 
380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.1 
 
 
368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.64 
 
 
395 aa  305  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.34 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.69 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.41 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.74 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.74 
 
 
383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.12 
 
 
373 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
387 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.48 
 
 
373 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0577  queuine/other tRNA- ribosyl transferase  41.69 
 
 
396 aa  300  4e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0321694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.34 
 
 
380 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.34 
 
 
380 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.08 
 
 
377 aa  299  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.81 
 
 
384 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.9 
 
 
376 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.21 
 
 
374 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.42 
 
 
396 aa  297  3e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.42206  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.41 
 
 
383 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.25 
 
 
376 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.45 
 
 
377 aa  296  6e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.74 
 
 
336 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  40 
 
 
373 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.79 
 
 
383 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.1 
 
 
381 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.95 
 
 
376 aa  293  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.83 
 
 
387 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.18 
 
 
376 aa  292  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.8 
 
 
388 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.68 
 
 
371 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
385 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.1 
 
 
374 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.98 
 
 
392 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.63 
 
 
387 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.9 
 
 
379 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>