More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0560 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0560  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
424 aa  874    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5036  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.77 
 
 
410 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5329  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.77 
 
 
410 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4948  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.77 
 
 
410 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.93 
 
 
402 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5580  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.92 
 
 
401 aa  615  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0599  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.92 
 
 
435 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0727  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.19 
 
 
434 aa  591  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03090  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.88 
 
 
441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.576454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0411  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.89 
 
 
417 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26670  tRNA-guanine transglycosylase  67.73 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1354  Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  63.48 
 
 
437 aa  538  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1343  tRNA-guanine transglycosylase  62.56 
 
 
441 aa  536  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.161378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.99 
 
 
1382 aa  512  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.42 
 
 
394 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  44 
 
 
373 aa  345  8.999999999999999e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.33 
 
 
392 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.46 
 
 
375 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.11 
 
 
373 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.67 
 
 
400 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.99 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.12 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.12 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.12 
 
 
383 aa  336  5e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.44 
 
 
369 aa  334  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.6 
 
 
380 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.83 
 
 
372 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.6 
 
 
379 aa  333  5e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.83 
 
 
372 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.93 
 
 
373 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.53 
 
 
370 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.86 
 
 
380 aa  330  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.16 
 
 
382 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.67 
 
 
370 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.62 
 
 
379 aa  329  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  41 
 
 
380 aa  329  7e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.04 
 
 
380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.01 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.27 
 
 
369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.41 
 
 
383 aa  327  3e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.16 
 
 
383 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.08 
 
 
374 aa  326  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.91 
 
 
368 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.25 
 
 
368 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.58 
 
 
384 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3728  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.14 
 
 
403 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.19 
 
 
380 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.3 
 
 
357 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.25 
 
 
368 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.16 
 
 
368 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.98 
 
 
379 aa  323  5e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.78 
 
 
379 aa  323  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.56 
 
 
365 aa  322  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.97 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.52 
 
 
379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.52 
 
 
379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.84 
 
 
384 aa  320  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.78 
 
 
379 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.19 
 
 
374 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
379 aa  319  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
379 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
379 aa  319  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
379 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
379 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
379 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
379 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.76 
 
 
380 aa  318  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.71 
 
 
371 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.94 
 
 
395 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.39 
 
 
376 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.9 
 
 
388 aa  316  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.17 
 
 
375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.25 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.25 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.25 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.77 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.75 
 
 
387 aa  312  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.93 
 
 
381 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.87 
 
 
368 aa  312  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.05 
 
 
392 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.03 
 
 
381 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.1 
 
 
373 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.72 
 
 
370 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.79 
 
 
373 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.16 
 
 
355 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.78 
 
 
373 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.9 
 
 
387 aa  311  2e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.4 
 
 
380 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.97 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.75 
 
 
374 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.27 
 
 
387 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.9 
 
 
387 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.97 
 
 
372 aa  308  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.29 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.2 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.2 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.54 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.13 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.34 
 
 
381 aa  306  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.04 
 
 
392 aa  305  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>