More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12880  pantothenate synthetase  100 
 
 		 291 aa  567  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00593935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  53.51 
 
 		 287 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  53.31 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  58.3 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  52.63 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  54.44 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  51.25 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  49.22 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 273 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.34 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  48.39 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  53.76 
 
 		 324 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.3 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  52.16 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  43.41 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.91 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  39.45 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  47.88 
 
 		 289 aa  205  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  40.94 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  48.46 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 618 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.52 
 
 		 527 aa  202  8e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  55.22 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  43.68 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.44 
 
 		 529 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.33 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  55.22 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  44.96 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  52.25 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0436  pantoate/beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  42.02 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  43.96 
 
 		 539 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  39.78 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.13 
 
 		 526 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.57 
 
 		 511 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  46.7 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  46.7 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.75 
 
 		 534 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  48.13 
 
 		 334 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  49.21 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01440  pantothenate synthetase  46.23 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  42.28 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.89 
 
 		 511 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  43.41 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  41.01 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  43.19 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.03 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  42.41 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.43 
 
 		 528 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 282 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 282 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  42.91 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.77 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0501  pantoate--beta-alanine ligase  37.92 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  43.58 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  43.96 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 283 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  40.62 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  47.49 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  46.51 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  43.68 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  39.93 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  43.42 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  43.02 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  46.9 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  51.63 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  45.28 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  44.12 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1446  pantoate--beta-alanine ligase  46.05 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1770  pantoate--beta-alanine ligase  46.05 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  48.48 
 
 		 290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  42.32 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  46.42 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>