91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  100 
 
 		 594 aa  1169    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  61.54 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  32.18 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  34.68 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  31.25 
 
 		 474 aa  187  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  29.45 
 
 		 541 aa  183  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  33.57 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  33.48 
 
 		 479 aa  178  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  31.21 
 
 		 547 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  29.93 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  33 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  33.18 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  32.24 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  32.24 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  32.16 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  32.16 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  29.58 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  32.13 
 
 		 426 aa  159  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  33.17 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  33.17 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  33.17 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  30.42 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  31.66 
 
 		 430 aa  157  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  30.97 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  30.86 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  30.87 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  29.14 
 
 		 403 aa  154  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  30.42 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  33.94 
 
 		 424 aa  150  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  32.74 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  32 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  30.75 
 
 		 423 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  40.38 
 
 		 430 aa  124  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  43.26 
 
 		 256 aa  122  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  43.15 
 
 		 404 aa  121  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  40 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  39.57 
 
 		 405 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  40.96 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  43.59 
 
 		 268 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.13 
 
 		 580 aa  94  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  27.35 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  25.43 
 
 		 558 aa  87  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  25.3 
 
 		 535 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  26.02 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  23.53 
 
 		 585 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  26.32 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  23.76 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  25.06 
 
 		 584 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  27.6 
 
 		 340 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  25.06 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  28.95 
 
 		 628 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  28.06 
 
 		 748 aa  71.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  26.81 
 
 		 637 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  23.2 
 
 		 620 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  23.3 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  23.31 
 
 		 568 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  24.42 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  22.63 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  25.69 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  24.03 
 
 		 507 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  36.47 
 
 		 714 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  25.13 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  25.93 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  25.69 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  29.21 
 
 		 605 aa  58.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  24.81 
 
 		 516 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  28.74 
 
 		 580 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  49.15 
 
 		 480 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  49.15 
 
 		 480 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  49.15 
 
 		 480 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 432 aa  50.8  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  31.25 
 
 		 418 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.54 
 
 		 484 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  33.68 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  27.34 
 
 		 222 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 743 aa  47.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  32.63 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 535 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  30.16 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  37.5 
 
 		 232 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  34.91 
 
 		 578 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  40.68 
 
 		 511 aa  44.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  32.81 
 
 		 488 aa  44.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  32.63 
 
 		 440 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.54 
 
 		 567 aa  44.3  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 620 aa  44.3  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  34.91 
 
 		 498 aa  43.9  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  38.14 
 
 		 578 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  23.72 
 
 		 512 aa  43.9  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  31.58 
 
 		 436 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>