More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2240 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  88.15 
 
 		 288 aa  530  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  87.8 
 
 		 288 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  87.76 
 
 		 290 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  86.36 
 
 		 290 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  86.36 
 
 		 290 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  86.36 
 
 		 290 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  86.36 
 
 		 290 aa  519  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  86.71 
 
 		 290 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  85.66 
 
 		 290 aa  517  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  35.17 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  31.01 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 699 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.48 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  27.48 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  29.62 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  28.57 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  28.57 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  28.57 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  28.43 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.17 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.33 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  26.26 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.82 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  25.98 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2284  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.471609  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  29.09 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  25.34 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.01 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>