52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6621 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  96.51 
 
 
374 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  96.51 
 
 
374 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  96.25 
 
 
374 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  82.88 
 
 
371 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  80.65 
 
 
376 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  57.41 
 
 
374 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  57.41 
 
 
374 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  57.41 
 
 
374 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  57.14 
 
 
374 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  57.14 
 
 
374 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  47.44 
 
 
377 aa  332  6e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  41.58 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  28.19 
 
 
481 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  27.52 
 
 
481 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  27.94 
 
 
482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  29.02 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  29.82 
 
 
454 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  26.67 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  29.47 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  27.05 
 
 
481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  29.98 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  28.36 
 
 
600 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  27.44 
 
 
473 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  26.3 
 
 
481 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  27.38 
 
 
597 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  26.14 
 
 
597 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  26.52 
 
 
474 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  23.67 
 
 
600 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  32.14 
 
 
494 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  27.63 
 
 
597 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  28.73 
 
 
439 aa  99.4  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  27.87 
 
 
1022 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  25.76 
 
 
483 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  25.33 
 
 
477 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  28.45 
 
 
434 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  28.2 
 
 
915 aa  86.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  25.98 
 
 
618 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  26.99 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  30.05 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  23.65 
 
 
562 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  27.78 
 
 
514 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  29.58 
 
 
450 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  27.34 
 
 
545 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  24.44 
 
 
1349 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  24.73 
 
 
626 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  26.12 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 
572 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  23.38 
 
 
628 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1349  hypothetical protein  24.18 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1927  hypothetical protein  22.58 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  28.11 
 
 
310 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>