More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1131 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  78.83 
 
 
484 aa  744    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  94.74 
 
 
494 aa  951    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  92.71 
 
 
494 aa  931    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  78.4 
 
 
497 aa  749    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  78.83 
 
 
484 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  78.83 
 
 
484 aa  742    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  78.83 
 
 
484 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  77.91 
 
 
546 aa  747    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  100 
 
 
494 aa  998    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  79.45 
 
 
497 aa  748    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  79.04 
 
 
484 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  94.74 
 
 
494 aa  951    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  92.31 
 
 
494 aa  933    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  94.74 
 
 
494 aa  951    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  92.91 
 
 
494 aa  935    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  63.75 
 
 
556 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  61.32 
 
 
505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  59.87 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  59.67 
 
 
485 aa  558  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  58.58 
 
 
494 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  59.23 
 
 
485 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  58.8 
 
 
485 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  56.78 
 
 
485 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  56.9 
 
 
485 aa  519  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  56.32 
 
 
485 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  55.65 
 
 
521 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  54.11 
 
 
494 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  53.66 
 
 
491 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  52.68 
 
 
494 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  52.7 
 
 
486 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  53.14 
 
 
480 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  51.71 
 
 
481 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  52.35 
 
 
481 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  49.58 
 
 
495 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  47 
 
 
472 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  48.57 
 
 
472 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  48.37 
 
 
477 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  50.78 
 
 
480 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  48.81 
 
 
472 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  47.17 
 
 
475 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  46.07 
 
 
463 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  48.26 
 
 
463 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  46.78 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  45.97 
 
 
459 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  44.14 
 
 
490 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  43.87 
 
 
472 aa  322  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  43.93 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  42.35 
 
 
487 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  42.09 
 
 
473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  41.08 
 
 
479 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  42.34 
 
 
468 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  37.95 
 
 
473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  41.88 
 
 
509 aa  266  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  38.8 
 
 
477 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  37.21 
 
 
477 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  41.26 
 
 
516 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  40.96 
 
 
516 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  36.05 
 
 
495 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  38.89 
 
 
473 aa  253  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  37.1 
 
 
477 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  39.08 
 
 
498 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  40.43 
 
 
492 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  35.36 
 
 
482 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  41.29 
 
 
498 aa  246  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  38.51 
 
 
507 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  39.83 
 
 
522 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  38.17 
 
 
507 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  39.96 
 
 
507 aa  239  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  36.52 
 
 
471 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  39.45 
 
 
507 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  35.77 
 
 
480 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  40.08 
 
 
508 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  38.63 
 
 
506 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  33.9 
 
 
475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.64 
 
 
485 aa  209  9e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  34.74 
 
 
495 aa  206  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.04 
 
 
486 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  34.39 
 
 
471 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.04 
 
 
486 aa  205  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.61 
 
 
469 aa  203  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  36.13 
 
 
458 aa  203  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  37.61 
 
 
535 aa  203  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  37.32 
 
 
492 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.95 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.2 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.57 
 
 
486 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.93 
 
 
485 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.99 
 
 
487 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  33.05 
 
 
483 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.33 
 
 
505 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.71 
 
 
483 aa  193  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.9 
 
 
484 aa  193  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  32.72 
 
 
486 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  33.19 
 
 
467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.36 
 
 
482 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.24 
 
 
486 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  32.36 
 
 
463 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.45 
 
 
485 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.54 
 
 
485 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.99 
 
 
485 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>