More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5036 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  96.86 
 
 		 223 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  58.72 
 
 		 292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  52.75 
 
 		 218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  48.62 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  51.38 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  50.92 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  50.92 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  48.15 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  37.56 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 168 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  37.8 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  42.26 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  38.41 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  35.56 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  38.46 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  38.6 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  37.43 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  34.57 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  37.35 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  37.95 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  38.41 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  35.64 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.13 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  35.64 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  33.94 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  39.63 
 
 		 318 aa  95.9  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  34.69 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  34.69 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  37.13 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  38.37 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  34.5 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  34.5 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  36.09 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  35.75 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  34.17 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  35.5 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  36.42 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  39.41 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  38.01 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  36.21 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  35.76 
 
 		 191 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  36.57 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  35.63 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  35.68 
 
 		 256 aa  88.2  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  35.8 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.42 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  37.06 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.42 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.42 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.42 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  35.03 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  30.66 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  37.06 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  35.75 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  34.68 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  32.97 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  35.71 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  35.71 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  35.71 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  35.71 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  35.71 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  35.71 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  35.71 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  33.72 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  30.74 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 206 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  37.43 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  32.37 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.68 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  33.53 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  35.5 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  32.97 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  35.8 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  36.31 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>