138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6838 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
159 aa  323  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  62.89 
 
 
159 aa  207  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  48.08 
 
 
155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  48.08 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  48.08 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  48.08 
 
 
174 aa  133  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  45.16 
 
 
167 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  44.37 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  38.22 
 
 
159 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  43.59 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  37.5 
 
 
146 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  38.65 
 
 
164 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  40.88 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  60.78 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  38.31 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  38.31 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  50 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  40.3 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  33.64 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  33.64 
 
 
134 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  33.64 
 
 
134 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  32.11 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  45.9 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  37.1 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  37.1 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  37.1 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  37.1 
 
 
106 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  37.1 
 
 
106 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  37.1 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  37.1 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  35.48 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 
115 aa  54.7  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  51.92 
 
 
131 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  44.26 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  29.49 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  37.97 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  30.19 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  30.19 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  30.19 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  30.19 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  32.84 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 
126 aa  50.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  34.38 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  37.31 
 
 
125 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  37.14 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  32.26 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  46.15 
 
 
121 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  46.15 
 
 
121 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  46.15 
 
 
121 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  46.15 
 
 
121 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  46.15 
 
 
121 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  46.15 
 
 
121 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  36.36 
 
 
139 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  27.86 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  36.36 
 
 
139 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  56.76 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  34.62 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  36.62 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  36.62 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  36.99 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  41.54 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  59.38 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  59.38 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  59.38 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  59.38 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  59.38 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  41.54 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  31.11 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  36.99 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>