More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4154 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  100 
 
 		 282 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  100 
 
 		 282 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  93.97 
 
 		 282 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  83.57 
 
 		 282 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  81.21 
 
 		 282 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  79.43 
 
 		 282 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  76.79 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  65.95 
 
 		 283 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  63.54 
 
 		 291 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  63.54 
 
 		 291 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  63.54 
 
 		 291 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  63.54 
 
 		 291 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  63.54 
 
 		 291 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  63.18 
 
 		 291 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  62.01 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  61.45 
 
 		 281 aa  314  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  51.8 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  56.13 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  51.11 
 
 		 275 aa  232  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  44.21 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.71 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  43.73 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  38.85 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  38.13 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.87 
 
 		 291 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.59 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  37.05 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.43 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  40 
 
 		 240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  31.46 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  40.5 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  40.64 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  38.55 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  38.87 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  32.36 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  37.55 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  32.83 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  31.62 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  35.47 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.98 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.28 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.05 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  34.01 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  32.78 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.46 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.03 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  26.92 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 581 aa  62.4  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.37 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.37 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  28.97 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.54 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.54 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  31.49 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.53 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  30.4 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>