More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3673 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3673  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 278 aa  544  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  25.68 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.31 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 261 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 257 aa  95.5  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.39 
 
 		 249 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  25.29 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.87 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  33.86 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.45 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.82 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  28.39 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3645  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.9 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.75 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  26.07 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  25.69 
 
 		 278 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.24 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 259 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 257 aa  85.5  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  28.79 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.68 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.68 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.68 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  28.62 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.68 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  28.79 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.68 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.24 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  26.17 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.46 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  30.39 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  29.41 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  29.41 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  32.49 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  29.41 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  29.41 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  29.41 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  25.39 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  24.8 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  30.28 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 601 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>