64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1000 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 710 aa  1383    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  36.77 
 
 		 755 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  33.14 
 
 		 545 aa  113  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  33.12 
 
 		 401 aa  103  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  29.53 
 
 		 266 aa  93.2  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  30.79 
 
 		 523 aa  87.4  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  32.96 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1278 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  55.56 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  24.27 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  44.83 
 
 		 2272 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  42.68 
 
 		 2179 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  26.14 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  27.73 
 
 		 642 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  54.44 
 
 		 2313 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  28.81 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.37 
 
 		 303 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.55 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  36.81 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0650  hypothetical protein  28.62 
 
 		 300 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  47.76 
 
 		 1281 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  26.34 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  37.23 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  53.03 
 
 		 433 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.02 
 
 		 830 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.17 
 
 		 261 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  45.95 
 
 		 551 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  47.14 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  56.1 
 
 		 625 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  50 
 
 		 522 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  41.67 
 
 		 667 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  54.29 
 
 		 487 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  38.67 
 
 		 926 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  43.42 
 
 		 1977 aa  51.2  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  59.02 
 
 		 489 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.05 
 
 		 257 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  45.45 
 
 		 489 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 		 846 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  40.74 
 
 		 916 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0813  DNA-binding protein HU  36.51 
 
 		 208 aa  48.5  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.911341  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  58.95 
 
 		 848 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  40.54 
 
 		 488 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6550  hypothetical protein  25.56 
 
 		 277 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.236585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  27.1 
 
 		 671 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  63.16 
 
 		 764 aa  47  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  32.61 
 
 		 840 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.45 
 
 		 445 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 772 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  25.91 
 
 		 835 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  68.66 
 
 		 2353 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  33.98 
 
 		 582 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  34.94 
 
 		 630 aa  45.8  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  52.94 
 
 		 611 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  52.94 
 
 		 611 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  55.56 
 
 		 613 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  40.7 
 
 		 778 aa  45.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  48.53 
 
 		 572 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  60 
 
 		 431 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  60 
 
 		 430 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3348  hypothetical protein  27.97 
 
 		 913 aa  44.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5165  hypothetical protein  44.83 
 
 		 570 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3711  peptidase-like  53.97 
 
 		 232 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.73 
 
 		 1888 aa  44.3  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  39.73 
 
 		 472 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>