11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6550 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6550  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.236585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.62 
 
 		 303 aa  318  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.49 
 
 		 319 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  31.23 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  32.27 
 
 		 523 aa  85.5  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  31.33 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.45 
 
 		 545 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1278 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  25 
 
 		 710 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  45.61 
 
 		 438 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  22.8 
 
 		 755 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>