More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0725 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  100 
 
 
322 aa  636    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  74.36 
 
 
320 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  69.52 
 
 
322 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  67.97 
 
 
336 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  67.95 
 
 
323 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  62.38 
 
 
317 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  60.13 
 
 
364 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  65.4 
 
 
321 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  62.66 
 
 
314 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  60.32 
 
 
338 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  60.83 
 
 
327 aa  363  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  62.38 
 
 
314 aa  339  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  59.42 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  64.17 
 
 
325 aa  335  9e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  61.86 
 
 
321 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  61.08 
 
 
320 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  58.2 
 
 
312 aa  316  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  57.74 
 
 
323 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  44.76 
 
 
317 aa  225  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  36.72 
 
 
645 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  36.72 
 
 
645 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  38.86 
 
 
645 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  37.8 
 
 
647 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  37.43 
 
 
647 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  34.36 
 
 
628 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  35.54 
 
 
636 aa  179  8e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  33.74 
 
 
628 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  36.64 
 
 
640 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  35.24 
 
 
634 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  36.78 
 
 
643 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  35.14 
 
 
680 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 
652 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  34.94 
 
 
634 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  34.83 
 
 
681 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
642 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  36.86 
 
 
635 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  34.73 
 
 
670 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 
636 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  34.93 
 
 
656 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  34.93 
 
 
654 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  35.63 
 
 
646 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  35.06 
 
 
630 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  34.71 
 
 
642 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  32.93 
 
 
335 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  34.74 
 
 
337 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 
659 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  31.93 
 
 
655 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  36.14 
 
 
674 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  36.5 
 
 
666 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  36.5 
 
 
666 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  36.5 
 
 
666 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  36.5 
 
 
666 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  34.66 
 
 
625 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  33.23 
 
 
634 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  36.5 
 
 
666 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  36.5 
 
 
666 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  36.5 
 
 
666 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  33.53 
 
 
633 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  36.2 
 
 
666 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  38.34 
 
 
650 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  38.11 
 
 
651 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  38.04 
 
 
651 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  37.73 
 
 
651 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  36.81 
 
 
646 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  31.02 
 
 
644 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  31.02 
 
 
644 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  36.5 
 
 
652 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  35.89 
 
 
651 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  35.89 
 
 
651 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  35.89 
 
 
651 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  29.78 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  28.71 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  32.58 
 
 
324 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  29.47 
 
 
332 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  29.47 
 
 
332 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  29.47 
 
 
332 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  29.47 
 
 
332 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  33.97 
 
 
326 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  30.09 
 
 
338 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  33.33 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.3 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  32.3 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 
322 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  29.93 
 
 
321 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.86 
 
 
323 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  39.59 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  31.51 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  34.42 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.22 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  28.53 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.84 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.1 
 
 
323 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  28.53 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  28.21 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.11 
 
 
307 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  28.21 
 
 
319 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.89 
 
 
315 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.34 
 
 
325 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>