66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6223 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6223  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6231  phosphopantetheine-binding  45.95 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  45.71 
 
 		 3494 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  40.23 
 
 		 897 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 1292 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 1272 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  42.31 
 
 		 3355 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 		 2103 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  42.03 
 
 		 5255 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.06 
 
 		 3158 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  43.4 
 
 		 2666 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  30.93 
 
 		 1208 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  44.9 
 
 		 1831 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  34.12 
 
 		 2507 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  36.36 
 
 		 2126 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01916  hypothetical protein  39.62 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.41353  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 662 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1007  Beta-ketoacyl synthase  41.18 
 
 		 1974 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  40.82 
 
 		 3033 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  40.3 
 
 		 7210 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.46 
 
 		 2762 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.48 
 
 		 3254 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  33.82 
 
 		 1283 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  45.65 
 
 		 5154 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  33.82 
 
 		 1291 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 		 3092 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.44 
 
 		 4930 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.67 
 
 		 544 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  35.48 
 
 		 3427 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11681  polyketide synthase pks17  42.86 
 
 		 502 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000530022  normal  0.704924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  40.43 
 
 		 2108 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  41.18 
 
 		 4111 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  42.55 
 
 		 3493 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  34.78 
 
 		 3424 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30000  polyketide synthase  38.78 
 
 		 18193 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  47.73 
 
 		 1789 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  43.14 
 
 		 2547 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  42.55 
 
 		 2966 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  43.48 
 
 		 2277 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 1323 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  44.23 
 
 		 1190 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  32.35 
 
 		 1276 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  42.55 
 
 		 3711 aa  42  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 7110 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  35.59 
 
 		 2393 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  40 
 
 		 3408 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  38.1 
 
 		 5526 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 1874 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  41.67 
 
 		 2367 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  37.93 
 
 		 3925 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  34.62 
 
 		 1832 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  34.38 
 
 		 4840 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  41.18 
 
 		 7149 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  42.31 
 
 		 2066 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  35.71 
 
 		 1955 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.22 
 
 		 2880 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  44.9 
 
 		 3670 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  34.48 
 
 		 1548 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  37.25 
 
 		 1402 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 		 701 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  36.51 
 
 		 6768 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  38 
 
 		 1616 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  43.64 
 
 		 1017 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 1837 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  42.31 
 
 		 1190 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  42.31 
 
 		 1190 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>