101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01916 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01916  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.41353  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2735  phosphopantetheine-binding  44.57 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  46.58 
 
 		 2103 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  40.79 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  40.79 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  40.79 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  38.46 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  37.5 
 
 		 2762 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  40.24 
 
 		 3337 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2877  phosphopantetheine-binding  39.08 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4741  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711261  normal  0.224545 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 		 1474 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3020  phosphopantetheine-binding  32.05 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3102  phosphopantetheine-binding  32.05 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0141016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.94 
 
 		 544 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1647  phosphopantetheine-binding  36.62 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546913 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 1292 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 1272 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.43 
 
 		 6889 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 1656 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.14 
 
 		 2333 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  38.24 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 662 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  34.62 
 
 		 897 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  30.23 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  30.23 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5327  phosphopantetheine-binding  36.49 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  32.97 
 
 		 1580 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  36.25 
 
 		 1823 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  31.87 
 
 		 1580 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  31.87 
 
 		 1580 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0180  hypothetical protein  29.67 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1219  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  30.23 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1669  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  29.67 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1587  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  29.67 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.059476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  35 
 
 		 1828 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.18 
 
 		 1939 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  29.87 
 
 		 2393 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  34.29 
 
 		 1876 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 		 1581 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  32.1 
 
 		 505 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  33.33 
 
 		 4874 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  33.33 
 
 		 3818 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  33.33 
 
 		 5023 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  33.33 
 
 		 5021 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6560  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  31.65 
 
 		 1291 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  31.65 
 
 		 1283 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 1577 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  35.82 
 
 		 1819 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 1323 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  32.47 
 
 		 5612 aa  48.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1185  Acyl transferase  30.12 
 
 		 626 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  30.49 
 
 		 1573 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  30.38 
 
 		 1276 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  35.71 
 
 		 1822 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  26.83 
 
 		 1208 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  30 
 
 		 1717 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3405  phosphopantetheine-binding  28.17 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  30.43 
 
 		 4212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0274  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  25.74 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 		 2975 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6223  phosphopantetheine-binding  39.62 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  30.43 
 
 		 5822 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  30.43 
 
 		 5778 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  30.43 
 
 		 5915 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  30.43 
 
 		 5993 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  27.03 
 
 		 4036 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4453  phosphopantetheine-binding protein  29.07 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1606  phosphopantetheine-binding  30.99 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  27.55 
 
 		 7157 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1633  phosphopantetheine-binding  27.27 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0617964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  30.3 
 
 		 2719 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  34.85 
 
 		 4151 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 		 1835 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  24.72 
 
 		 2363 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1019  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  25.93 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00932782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0296  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  25.93 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.444896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1797  Acyl carrier protein  27.27 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1711  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  25.93 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1299  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  25.93 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  29.35 
 
 		 7149 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  29.58 
 
 		 506 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  38.18 
 
 		 3099 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  31.43 
 
 		 1812 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  28.17 
 
 		 6876 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 2376 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  35.38 
 
 		 2547 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  31.17 
 
 		 3176 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11681  polyketide synthase pks17  35.29 
 
 		 502 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000530022  normal  0.704924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  31.48 
 
 		 2374 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  28.75 
 
 		 5628 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  29.07 
 
 		 1698 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  21.78 
 
 		 3099 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  30.99 
 
 		 1696 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  32.86 
 
 		 4649 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1667  polyketide synthase, putative  31.58 
 
 		 1901 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  31.43 
 
 		 3925 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  31.15 
 
 		 1955 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3505  phosphopantetheine-binding protein  36.54 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0302497 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>