139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6560 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6560  acyl carrier protein  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1797  Acyl carrier protein  47.5 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1019  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  49.33 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0274  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  49.33 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0296  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  49.33 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.444896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1711  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  49.33 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1299  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  49.33 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18390  phosphopantetheine-containing protein  45.78 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.674444  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2735  phosphopantetheine-binding  34.21 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  46.3 
 
 
1744 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 
2103 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  43.14 
 
 
1698 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
1939 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1647  phosphopantetheine-binding  31.94 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.546913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  36.23 
 
 
1835 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  37.14 
 
 
1820 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  34.62 
 
 
2890 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  30.56 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  30.56 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1219  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  36.36 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3102  phosphopantetheine-binding  31.08 
 
 
91 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0141016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 
1837 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3020  phosphopantetheine-binding  31.08 
 
 
91 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01916  hypothetical protein  32.05 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.41353  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  34.25 
 
 
2162 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0180  hypothetical protein  30.86 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1669  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  30.86 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1587  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  30.86 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.059476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.14 
 
 
2762 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  33.82 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13834  polyketide synthase pks13  33.33 
 
 
1733 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.924162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  35.21 
 
 
1832 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  36.07 
 
 
1704 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  36.07 
 
 
1704 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  36.07 
 
 
1704 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 
4183 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  34.38 
 
 
2111 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 
1840 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1169  beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 
1778 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  31.82 
 
 
2719 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
505 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  37.14 
 
 
2374 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  29.73 
 
 
506 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  28.77 
 
 
1656 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  45.24 
 
 
755 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.43 
 
 
544 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6231  phosphopantetheine-binding  30.95 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  35.85 
 
 
1474 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 
2477 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  32.47 
 
 
1823 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1007  Beta-ketoacyl synthase  32.86 
 
 
1974 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  32.86 
 
 
2333 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  32.88 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  27.5 
 
 
6876 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5327  phosphopantetheine-binding  30.43 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  36.23 
 
 
1819 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 
2975 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  31.17 
 
 
1828 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  31.88 
 
 
1876 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  33.85 
 
 
2230 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1185  Acyl transferase  31.94 
 
 
626 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  36.36 
 
 
3099 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.51 
 
 
1867 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  33.8 
 
 
7149 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  38.6 
 
 
2376 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36.21 
 
 
3449 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
2232 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  36 
 
 
2380 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4453  phosphopantetheine-binding protein  30.14 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  31.17 
 
 
4874 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  32.89 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  27.78 
 
 
1704 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  32.89 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  32.89 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  27.27 
 
 
1402 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4741  phosphopantetheine-binding  31.88 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711261  normal  0.224545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1606  phosphopantetheine-binding  30.67 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  32.86 
 
 
2653 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  32.86 
 
 
2726 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  31.17 
 
 
5021 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
1584 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  33.85 
 
 
4212 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  30.12 
 
 
1759 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  33.87 
 
 
5822 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  33.87 
 
 
5778 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  40.74 
 
 
2966 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  33.85 
 
 
5993 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  31.43 
 
 
4151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
585 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 
1955 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  38.6 
 
 
3400 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  33.85 
 
 
1263 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2877  phosphopantetheine-binding  25.3 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 
662 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  35.82 
 
 
3337 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  36.11 
 
 
3355 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  32.26 
 
 
5915 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  37.04 
 
 
1190 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.19 
 
 
2363 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
3092 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>