246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5078 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  93.29 
 
 		 343 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  97.67 
 
 		 343 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  95.04 
 
 		 343 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 357 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  95.04 
 
 		 343 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  94.75 
 
 		 343 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  88.34 
 
 		 343 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  82.99 
 
 		 343 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  81.52 
 
 		 343 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  72.29 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  59.88 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  59.82 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  58.68 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  56.56 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  55.56 
 
 		 368 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  54.95 
 
 		 368 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  54.65 
 
 		 368 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  52.55 
 
 		 358 aa  348  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  54.08 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  53.87 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  53.87 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  53.87 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  53.87 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  53.87 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  53.87 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  51.5 
 
 		 358 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  53.57 
 
 		 368 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  51.35 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  51.35 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  53.57 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  52.28 
 
 		 358 aa  338  9e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  50.75 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  51.04 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  52.8 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  50.6 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  51.71 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  52.91 
 
 		 336 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  50.61 
 
 		 353 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  50.94 
 
 		 348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  54.05 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  50.86 
 
 		 353 aa  322  9.000000000000001e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  48.82 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  49.57 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  52.19 
 
 		 363 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  49.56 
 
 		 368 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  49.42 
 
 		 356 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  49.11 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  48.62 
 
 		 352 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  48.47 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 		 363 aa  316  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  51.1 
 
 		 361 aa  315  7e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  51.1 
 
 		 361 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  50.9 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  49.52 
 
 		 352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  50.46 
 
 		 353 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  47.56 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  50.15 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  49.55 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  49.25 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 		 362 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  45.43 
 
 		 352 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  51.96 
 
 		 352 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  52.44 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  45.66 
 
 		 337 aa  291  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  51.46 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  45.95 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  48 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  45.57 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  44.74 
 
 		 337 aa  223  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  38.28 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  37.95 
 
 		 401 aa  215  8e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 		 315 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 		 356 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  40.71 
 
 		 354 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  45.08 
 
 		 264 aa  210  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  35.82 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40.52 
 
 		 339 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  39.69 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  34.86 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  37.53 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  34.86 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.88 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.02 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  37.39 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  37.14 
 
 		 348 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  34.39 
 
 		 355 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  41.53 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  39.16 
 
 		 351 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  37.57 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  34.1 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  33.61 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  40.31 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  34.1 
 
 		 355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02490  conserved hypothetical protein  35.36 
 
 		 428 aa  182  6e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.1 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>