More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2231 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  97.68 
 
 		 302 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  94.04 
 
 		 302 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  94.04 
 
 		 302 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  93.71 
 
 		 302 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  93.38 
 
 		 297 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  88.59 
 
 		 299 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  88.59 
 
 		 299 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  88.59 
 
 		 299 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  86.91 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  88.41 
 
 		 299 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75.95 
 
 		 286 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  74.83 
 
 		 299 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  65.31 
 
 		 308 aa  364  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  66.32 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  65.64 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.71 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.71 
 
 		 308 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  88 
 
 		 154 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  88 
 
 		 154 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  91.37 
 
 		 143 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  91.37 
 
 		 143 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  42.9 
 
 		 320 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  41.47 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  42.76 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  43 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  42.22 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.88 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  41.75 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  39.86 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.84 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  40.33 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  41.69 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.71 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.81 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.62 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.62 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  31.13 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  35.62 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  34.24 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.68 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.87 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  31.76 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  30.98 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  33.11 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  32 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  31.68 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  30.64 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  33.89 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  30.43 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  31.33 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  30.43 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  29.79 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  32.11 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  32.99 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  33.23 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.51 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  30.94 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.5 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.5 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.47 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  31.16 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.5 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.71 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.14 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.14 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  30.47 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  30.47 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.5 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  28.67 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.47 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.81 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.99 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  30.82 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.24 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.97 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  31.89 
 
 		 268 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  31.89 
 
 		 268 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  31.89 
 
 		 268 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  34.69 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  28.87 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  30.1 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  27.85 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  24.91 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  28.81 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  27.15 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  23.2 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  25.47 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>