More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6308 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  100 
 
 		 394 aa  766    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  87.06 
 
 		 394 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  89.34 
 
 		 400 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  89.59 
 
 		 400 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  98.98 
 
 		 410 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  89.59 
 
 		 451 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  70.08 
 
 		 397 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  73.4 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  57.1 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  56.28 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  53.95 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  53.31 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  49.73 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  49.61 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  49.61 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  49.61 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  49.61 
 
 		 396 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  49.35 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  55.32 
 
 		 413 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  52.65 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  54.71 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  53.73 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  53.37 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  48.92 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  48.92 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  48.92 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  48.92 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  48.92 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  48.92 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  48.92 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  48.92 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  51.06 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  50.54 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  46.78 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  45.33 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  48.91 
 
 		 395 aa  306  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  48.65 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  46.17 
 
 		 393 aa  299  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  53.33 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 		 390 aa  295  8e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  43.42 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  42.93 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  43.13 
 
 		 399 aa  276  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  43.87 
 
 		 394 aa  260  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  43.87 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  38.92 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  30.58 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  30.27 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.39 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  30.11 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  30.11 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.11 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  30.39 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  28 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  28 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  28 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  28 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  28 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  28 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  29.22 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 392 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0118  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.254663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  30.77 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>