More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5549 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.69 
 
 		 498 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  88.96 
 
 		 504 aa  820    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  89.09 
 
 		 504 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  90.78 
 
 		 501 aa  853    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.26 
 
 		 498 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  89.88 
 
 		 504 aa  870    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 498 aa  992    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.2 
 
 		 497 aa  981    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  89.88 
 
 		 504 aa  870    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.66 
 
 		 508 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  65.98 
 
 		 501 aa  578  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.22 
 
 		 504 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  61.6 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.6 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  62.15 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.55 
 
 		 487 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.99 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.03 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  34.27 
 
 		 506 aa  293  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 488 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  32.73 
 
 		 496 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  32.85 
 
 		 494 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  28.84 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  29.41 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  34.56 
 
 		 496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30.32 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 493 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  36.4 
 
 		 352 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  35.52 
 
 		 486 aa  136  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 1153 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 604 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 608 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 597 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 581 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 473 aa  133  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  34.34 
 
 		 347 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 463 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.83 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  33.86 
 
 		 810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 365 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  29.91 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.15 
 
 		 508 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.02 
 
 		 461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 446 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 499 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 639 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  32.12 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 463 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 619 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 640 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  25.41 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 597 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  28.03 
 
 		 356 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 458 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 458 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 470 aa  127  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  28.08 
 
 		 465 aa  127  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 571 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 885 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 504 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 597 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  28.81 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 639 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 599 aa  124  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.76 
 
 		 1162 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 945 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  28.62 
 
 		 502 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  32.93 
 
 		 910 aa  123  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 463 aa  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  29.28 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>