223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2439 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 737 aa  1346    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  53.27 
 
 		 827 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  47.6 
 
 		 1186 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  46.82 
 
 		 1068 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  56.29 
 
 		 617 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  46.35 
 
 		 1012 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  51.18 
 
 		 962 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  48.16 
 
 		 650 aa  321  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  44.19 
 
 		 601 aa  237  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  40.82 
 
 		 1654 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  41.19 
 
 		 2392 aa  220  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  40.71 
 
 		 1626 aa  204  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  40.71 
 
 		 1766 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  40.71 
 
 		 1535 aa  203  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  40.71 
 
 		 715 aa  203  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  40.71 
 
 		 1705 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  40.71 
 
 		 1669 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  69.63 
 
 		 135 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  69.63 
 
 		 135 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  55.08 
 
 		 1326 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  50.49 
 
 		 4384 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  35.66 
 
 		 1265 aa  174  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  32.81 
 
 		 2095 aa  173  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  38.49 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  35.86 
 
 		 536 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  49 
 
 		 4191 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  45.71 
 
 		 533 aa  154  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  33.8 
 
 		 810 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  47.18 
 
 		 460 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  53.94 
 
 		 1074 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  47.18 
 
 		 378 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  48.54 
 
 		 1309 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  53.94 
 
 		 1090 aa  151  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  53.94 
 
 		 1090 aa  151  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  53.94 
 
 		 1090 aa  151  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  53.94 
 
 		 1122 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  53.94 
 
 		 1122 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  53.94 
 
 		 1122 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  37.59 
 
 		 655 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  54.24 
 
 		 3635 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  46.56 
 
 		 525 aa  144  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  46.6 
 
 		 192 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  46.6 
 
 		 192 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  46.63 
 
 		 373 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  46.63 
 
 		 373 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  46.63 
 
 		 378 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  51.32 
 
 		 3718 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  52.54 
 
 		 4726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  48.47 
 
 		 3355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  49.08 
 
 		 1246 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  48.8 
 
 		 963 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  40.23 
 
 		 1674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  31.82 
 
 		 877 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  34.49 
 
 		 575 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  33.45 
 
 		 1613 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  32.23 
 
 		 589 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  37.24 
 
 		 1588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  46 
 
 		 2141 aa  122  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  30.41 
 
 		 1814 aa  120  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  32.48 
 
 		 1487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3593  YadA domain protein  40.72 
 
 		 742 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50488  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  34.42 
 
 		 691 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 		 1117 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  33.47 
 
 		 1471 aa  111  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  33.47 
 
 		 1471 aa  111  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  33.28 
 
 		 880 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  33.58 
 
 		 1854 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  32.65 
 
 		 997 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  36.87 
 
 		 2868 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  40 
 
 		 1616 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  31.01 
 
 		 597 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  31.01 
 
 		 597 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  40 
 
 		 1616 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  40 
 
 		 1616 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  31.7 
 
 		 1411 aa  107  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  28.55 
 
 		 1333 aa  107  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  33.06 
 
 		 1546 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  40.22 
 
 		 597 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  32.77 
 
 		 1434 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  32.63 
 
 		 876 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  33.55 
 
 		 878 aa  102  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  40.5 
 
 		 418 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  36.59 
 
 		 1230 aa  101  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  35.43 
 
 		 1516 aa  101  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  34.56 
 
 		 731 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  32.14 
 
 		 2396 aa  99  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  30.29 
 
 		 831 aa  98.2  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  38.08 
 
 		 1549 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  44.5 
 
 		 1417 aa  97.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  29.4 
 
 		 4526 aa  95.5  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 		 816 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 		 816 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 		 816 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 		 816 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  31.68 
 
 		 831 aa  94.4  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  31.68 
 
 		 831 aa  94.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  30.2 
 
 		 2866 aa  94  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  39.9 
 
 		 2832 aa  94  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  39.61 
 
 		 3192 aa  94  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 		 820 aa  94  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>