132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2407 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  41.74 
 
 
1921 aa  1209    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  98.44 
 
 
2055 aa  3879    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  53.65 
 
 
2016 aa  2065    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  100 
 
 
2067 aa  4139    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  80.12 
 
 
2019 aa  3315    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  91.45 
 
 
2064 aa  3637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  53.29 
 
 
1993 aa  2056    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  36.83 
 
 
1925 aa  1078    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  79.96 
 
 
2036 aa  3290    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  80.04 
 
 
2013 aa  3293    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  79.96 
 
 
2036 aa  3290    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.54 
 
 
2007 aa  1989    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.49 
 
 
1999 aa  1981    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.46 
 
 
2022 aa  1929    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  98.49 
 
 
2055 aa  3883    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  99.46 
 
 
2053 aa  4092    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  99.22 
 
 
2050 aa  3895    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  98.4 
 
 
2057 aa  3877    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.67 
 
 
1910 aa  990    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  50.63 
 
 
1994 aa  1911    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  80.82 
 
 
2013 aa  3286    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  51.47 
 
 
2006 aa  1927    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  51.29 
 
 
2012 aa  1996    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  79.87 
 
 
2022 aa  3264    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  80.23 
 
 
2013 aa  3291    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  66.47 
 
 
2020 aa  2761    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.35 
 
 
1971 aa  255  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.89 
 
 
1971 aa  247  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  28.59 
 
 
1974 aa  238  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25 
 
 
1872 aa  237  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.29 
 
 
1821 aa  219  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.19 
 
 
2191 aa  215  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.5 
 
 
1916 aa  204  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.4 
 
 
2195 aa  199  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.4 
 
 
1953 aa  191  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.03 
 
 
2002 aa  166  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.57 
 
 
2002 aa  157  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  21.08 
 
 
1906 aa  134  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.72 
 
 
1935 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.31 
 
 
1737 aa  123  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.79 
 
 
1704 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  23.02 
 
 
1869 aa  107  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.07 
 
 
1823 aa  105  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.76 
 
 
1927 aa  95.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  23.25 
 
 
1559 aa  95.5  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  23.85 
 
 
1744 aa  86.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  20.17 
 
 
1807 aa  85.5  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.95 
 
 
1833 aa  80.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  21.1 
 
 
1637 aa  78.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  22.14 
 
 
1646 aa  77  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.19 
 
 
1650 aa  77  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  21.8 
 
 
1727 aa  76.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.5 
 
 
1697 aa  76.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.74 
 
 
1594 aa  76.3  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  22.14 
 
 
1644 aa  75.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.15 
 
 
1897 aa  75.5  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  20.69 
 
 
1834 aa  75.1  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  23.3 
 
 
1603 aa  75.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  22.03 
 
 
1644 aa  74.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  22.03 
 
 
1644 aa  74.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.38 
 
 
1832 aa  73.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  20.04 
 
 
1898 aa  72.8  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  21.2 
 
 
1653 aa  72.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.2 
 
 
1653 aa  72  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  21.2 
 
 
1653 aa  72.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  25.44 
 
 
1815 aa  70.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.11 
 
 
1653 aa  70.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  23.99 
 
 
1759 aa  70.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  22.19 
 
 
1925 aa  70.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  24.81 
 
 
1808 aa  70.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.29 
 
 
1653 aa  69.7  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.29 
 
 
1653 aa  69.7  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.6 
 
 
1998 aa  69.3  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.8 
 
 
1785 aa  69.3  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.6 
 
 
1992 aa  69.3  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  23.33 
 
 
1737 aa  68.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.11 
 
 
1653 aa  68.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.01 
 
 
1653 aa  68.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.6 
 
 
1992 aa  68.6  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.32 
 
 
1596 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.67 
 
 
1808 aa  67.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.31 
 
 
1758 aa  67.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  19.89 
 
 
1921 aa  67.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.62 
 
 
1808 aa  67.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.54 
 
 
1652 aa  67.4  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  24.32 
 
 
1534 aa  66.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  24.32 
 
 
1534 aa  66.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  24.32 
 
 
1504 aa  66.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  24.32 
 
 
1504 aa  66.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  24.32 
 
 
1478 aa  66.6  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  24.32 
 
 
1504 aa  66.6  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.32 
 
 
1504 aa  66.6  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.17 
 
 
1872 aa  65.9  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.77 
 
 
1872 aa  65.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.05 
 
 
1768 aa  65.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  22.26 
 
 
1582 aa  63.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.65 
 
 
1682 aa  63.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.54 
 
 
1594 aa  63.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  19.23 
 
 
1921 aa  62.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.03 
 
 
1352 aa  62.4  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>